牧草種子加工設備的工作原理是利用種子和其它夾雜物的物理機械性能的不同來進行的。本機利用以下幾種特性實現分離：

　　（1）風選部分主要是按重量及空氣動力學特性，通過改變吸風道截面積大小得到不同氣流速度而達到提升種子和清選的目的。

　　在氣流作用下，喂料斗中的種子和雜物經喂料輥進入前吸風道，重雜質因其臨界速度大于氣流速度落到地面，種子和輕雜質被提升到前沉降室。由于前沉降室截面增大，空氣流速降低，種子將落到前沉降室底部，通過前閉風器葉輪勻速轉動不斷排出，落到上篩篩面上。輕雜質隨氣流進入中間沉降室，中間沉降室內氣流速度再次降低，有一部分輕雜質落到底部，通過交替開閉的活門落入排雜槽。其中zui輕的雜質隨氣流從風機口排出，進入旋風除塵器。

　　后吸風道位于后篩上面，種子和雜質流過后篩時，在氣流作用下呈“沸騰”狀態，其中臨界速度小于氣流速度的病弱、蟲蛀等較輕種粒及雜質被吸走，帶入后沉降室，由于后沉降室截面增大，氣流速度降低，較重的落入底部，通過后閉風器葉輪勻速轉動不斷送出到排雜槽。而輕雜質又隨氣流進入中沉降室，由于氣流速度再次降低，較輕雜質沉積底部，經交替活門進入排雜槽中，而zui輕雜質又從風機口排出。

　　（2）篩選是利用種子和混雜物之間在外形尺寸上的差別，通過一定規格的孔來分離雜物和瘦籽粒的。本機所用的篩片有圓孔和長孔兩種。

　　圓孔篩是按種粒的寬度進行分離，它與種粒的長度和厚度無關，種粒的寬度大于孔徑者不能通過。長孔篩是按種粒的厚度進行分離，種粒的厚度大于篩孔的寬度者不能通過。